Please use this identifier to cite or link to this item: https://cris.pasteurorg.ru/handle/123456789/234
Title: Молекулярно-генетическая характеристика изолятов парвовируса B19, циркулирующего на территории Северо-Западного федерального округа.
Other Titles: MOLECULAR-GENETIC CHARACTERISTICS OF PARVOVIRUS B19 ISOLATES CIRCULATING IN THE NORTH-WESTERN FEDERAL DISTRICT
Authors: Хамитова И. В.
Останкова Ю. В.
Антипова А. Ю.
Семенов А. В.
Лаврентьева И. Н.
Keywords: парвовирус В19, генотипирование, секвенирование, молекулярная эпидемиология
Issue Date: 2018
Publisher: S-info Moscow
Source: Хамитова И. В., Останкова Ю. В., Антипова А. Ю., Семенов А. В., Лаврентьева И. Н. Молекулярно-генетическая характеристика изолятов парвовируса B19, циркулирующего на территории Северо-Западного федерального округа. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2018. – № 6. – С. 55-61.
Journal: Zhurnal Mikrobiologii, ¿Pidemiologii i Immunobiologii 
Abstract: Цель. Генотипирование и молекулярно-генетическая характеристика парвовируса В19, циркулирующего на территории Северо-Западного федерального округа. Материалы и методы. В работе были использованы образцы сыворотки крови от 821 пациента с макуло-папулезной сыпью, поступившие в Санкт-Петербургский Региональный Центр по надзору за корью и краснухой в 2009-2017 гг., отрицательные по антителам IgM-корь и IgM-краснуха. В настоящем исследовании мы применили генотипирование на основе прямого секвенирования NS1/VP1 области генома парвовируса В19. Результаты. ДНК вируса выявлена у 59 (42,4%) серопозитивных больных. Для оценки гетерогенности изолятов были выбраны 14 образцов от пациентов из географически удаленных регионов СЗФО, разного возраста, вне зависимости от пола, с высокой вирусной нагрузкой (106-107 копий/мл). При филогенетическом анализе было показано, что во всех изолятах выявлен только генотип 1А. При этом нуклеотидные последовательности можно разделить на две подгруппы: 13 изолятов (92,8%) относились к подгруппе 1А2, один изолят к подгруппе 1А1. Заключение. Внедрение скрининга B19 от пациентов с лихорадкой/сыпью способно представить значимую информацию о распространенности парвовирусной инфекции в Российской Федерации. Выявление новых мутаций вируса и дальнейший анализ их возможных взаимосвязей с течением заболевания может помочь в разработке лекарств, а также в разработке эффективной вакцины против парвовируса В19.
Description: Aim. Genotyping and molecular genetic characteristics of parvovirus B19, circulating in the NorthWest Federal District. Material and Methods. The material of the study is based on serum samples from 821 patients with maculopapular rash negative for antibodies IgM-measles and IgM-rubella were received at the St. Petersburg Regional Center for Measles and Rubella Surveillance in 2009-2017. In the present study we used genotyping by direct sequencing of the NS1/VP1 region of Parvovirus B19 genome. Results. DNA of the virus was detected in 59 (42.4%) of seropositive patients. To assess the heterogeneity of isolates, 14 samples were selected from patients from geographically remote regions of the NWFO, of different ages, regardless of gender, with a high viral load (106 —107 copies/ml). Based on the phylogenetic analysis of the isolates showed that only the genotype 1A was detected in all isolates. The nucleotide sequences can be divided into two subgroups: 13 isolates (92.8%) belong to the subgroup 1A2, one isolate to the subgroup 1A1. Conclusion. The introduction of B19 screening from patients with fever / rash can provide meaningful information on the prevalence of parvovirus infection in the Russian Federation. Identifying new mutations of the virus and further analysis of their possible relationships with the course of the mutation disease can help in the development of medicines, as well as in the development of an effective vaccine against the parvovirus B19.
URI: https://cris.pasteurorg.ru/handle/123456789/234
ISSN: 0372-9311
Appears in Collections:Journal articles

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
329-132-1-PB.pdf294.59 kBAdobe PDFView/Open
Show full item record

Page view(s)

1
checked on Jul 18, 2019

Google ScholarTM

Check


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.